國發會為辦理管制考核政策之綜合性規劃、協調、審議及資源分配，設置管制考核處(以下簡稱管考處)，處內共分為6個科，並設處長1名、副處長1名。
本會管考處與行政院所屬機關之管考單位或綜合規劃單位不同之處，在於本處是負責中央部會各機關績效、計畫管制或專案列管、績效評估審核等事宜，各科名稱及執掌如下:
政策追蹤科
1.行政院重要會議決定、決議及院長指示事項之追蹤。
2.院長巡視地方指示事項之追蹤。
3.院長於立法院答詢承諾事項之追蹤。
4.行政院交下總統、副總統交辦事項之追蹤。
5.監察案件之追蹤及協調。
6.公共治理協調會報之規劃辦理。
7.行政院及所屬各機關出國人員出國報告之綜合處理。
8.其他交辦事項。
計畫管制科
1.管制考核制度之研究發展及資訊化作業。
2.行政院所屬各機關施政計畫分級選項作業之協調審議。
3.行政院所屬各機關施政計畫作業計畫審議及執行進度之管制。
4.行政院所屬各機關院管制施政計畫之查證。
5.行政院所屬各機關施政計畫之評核。
6.其他交辦事項。
建設管制科
1.行政院交辦重要公共建設專案列管計畫或方案執行之追蹤、協調及管制。
2.重要公共建設計畫執行之追蹤、協調及管制。
3.重要公共建設計畫之會審及查證。
4.重要公共建設計畫管考資料之統計分析。
5.其他交辦事項。
專案管制科
1.國家重大經建計畫推動執行機制及協調。
2.院交經濟發展類年度施政計畫之管制。
3.其他重要專案追蹤或協助審議。
4.屆期公共建設計畫執行成效檢討。
5.本會經建政策議題研究結論建議推動運用管制。
6.行政院交辦專案之調查。
7.其他交辦事項。
績效評估科
1.行政院所屬各機關年度施政績效評估之規劃、推動及執行。
2.行政院所屬各機關施政績效之彙整。
3.國營事業年度工作考成作業之規劃、推動及執行。
4.政府捐助之財團法人行政監督專案小組幕僚作業及行政監督總報告編撰。
5.其他交辦事項。
地方協調科
支援中興新村活化相關業務
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